以下是各集名称及简要剧情介绍
1X79 Pilot
Scully和Mulder第一次见面，两人去厄勒冈调查少年儿童森林失踪案，Scully腰上被咬了三个包。
1X01 深喉 Deep Throat
Scully和Mulder去调查一个空军基地，深喉第一次出现。Mulder最后被空军基地做了手术忘记了看到UFO。
1X02 突变异种 Squeeze
吃肝脏的Tooms，后来被抓起来了。
1X03 奥卡布基湖奇案 Conduit
湖边一家人的姐姐被劫持了，MS两人去调查，那家人的弟弟会从电视里看二进制码。后来Mulder在教堂里哭。
1X04 泽西恶魔 The Jersey Devil
新泽西发现野人，还是女的，Mulder看见她的美貌被迷住了。
1X05 鬼魅阴影(幽魂) Shadows
一个女职员的老板死了，生前老板对她好像女儿，死后还变做幽灵保护她受坏人的伤害。
1X06 幽灵电脑 Ghost in The Machine
一台大楼里的超级电脑有了自己的意识，想要杀死可能破坏它的人。
1X07 冰核计划 Ice
阿拉斯加冰核研究队因为冰核里的虫子全队覆灭。MS和几个科学家去调查，也因为虫子内讧。
1X08 太空惊魂 Space
火星上的脸附身到前宇航员身上，破坏穿梭机发射。
1X09 坠落天使 Fallen Angel
一架UFO坠落在森林里，Mulder去窥视，被军队抓了，认识了MUFON成员Max。后来Max被飞碟劫持了。
1X10 夺命夏娃 Eve
两个长得一摸一样的女娃子同时用同种方法杀死了自己的父亲。还有好多和她们一起被批量生产的女孩。
1X11 恶魔烈火 Fire
有人会控制火。Mulder怕火。Mulder有个英伦旧情人。
1X12 心灵感应 Beyond The Sea
Scully的爸爸死了。有个死囚能看穿Scully的心事。Mulder不喜欢Scully相信那个人，后来吃了一枪。
1X13 性别扭曲 Genderbender
有人会改变性别。MS调查到一个隐秘的小村里，Scully差点被玷污。后来整个村子人不见了。
1X14 至死不渝 Lazarus
Scully的前男友——也是一个探员的身体被一个犯人的占用了。犯人绑架了Scully，逃走去找爱人同伙，但发现被爱人出卖了。
1X15 追命恶魔 Young at Heart
Mulder年轻时候抓到的一个罪犯跑出来了，要找Mulder算帐。那个犯人的研究让他自己变年轻了。
1X16 外星访客 E.B.E.
据说一辆卡车运着UFO和alien，Mulder和Scully一路追去。孤枪侠首次出场。后来Mulder只看到一张曾放过alien尸体的空床。
1X17 神迹 MIRACLE MAN
一个传教士的干儿子什么的会用神迹治病，但最近治死了很多。Mulder和Scully去调查，发现是那个曾经被神迹救活于火灾的助手干的。Mulder不信宗教。
1X18 变形狼人 SHAPES
印第安保留区出现狼人。
1X19 夜幕低垂 DARKNESS FALLS
国家森林里出现一种虫子，在黑暗环境吸人体液，Mulder和Scully差点变木乃伊。
1X20 终结突变异种 TOOMS
吃人肝的Tooms被法庭放了，Mulder不服气，Tooms也不服气。最后Tooms被碾成了肉酱。这集里有“红茶对话”。
1X21 附身 BORN AGAIN
一个好警察被三个坏警察谋害了，好警察附身到一个小孩身上，实施复仇。
1X22 双胞奇缘 ROLAND
科学家哥哥的头在液氮里保存着，智障弟弟在研究所作清洁工。哥哥头脑仍然影响着弟弟帮他完成研究，并报复偷走他成果的人。
1X23 外星混血 THE ERLENMEYER FLASK
Mulder发现流着绿色血液的人类alien混种早已混迹在人群中。 深喉被杀害了。X档案被关闭。