再来说大和的起源:白皇的前身ICEMAN当时处于人类在日本列岛的研究所,而勘察加半岛地下也有人类的地下都市和研究机构。二代主角哈克和他哥哥(后来大和的“帝”)都是勘察加研究所的研究员。这些研究所间彼此相互隔绝,因此帝和哈克也只是通过黑客入侵获得了日本研究所的一些研究内容(比如能适应地表的亚人种的资料),对于解放者相关则并不知晓。帝根据亚人种获得灵感提出了改造人类基因使之适应地表的“真人计划”,哈克自愿成为实验体,于是在服下基因药物后被冷冻起来。
而后,日本方面杀害了命,触怒了解放者。解放者对全人类降下了成为“崇”的诅咒。但是日本以外的人类对解放者的事并不知晓。于是各地地下都市的人类毫无预兆地转化为崇开始吞噬周围的人,幸存的人们躲在冷冻装置中坐以待毙,更有些忍无可忍的人选择自尽……最后,被逼疯的人类自己发动了天照摧毁了所有地下都市。“帝”也对自己实施了“真人计划”因而没有转变为崇,但他却亲眼看着自己的妻子和女儿(穗香和杏树就是他妻儿的克隆体)变成崇。最后帝在无比的绝望和孤独中来到地表,利用天照调整了勘察加干旱的气候,又用获得的亚人种资料制造出亚人种,自称为“帝”交给他们知识、领导他们建立了大和。
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