这个故事有着一个并不鲜见的背景：十年前，东京内突然出现了一处不能解析的领域。从那里走出的人们受到了异现象影响，获得了操控生杀大权的超能力，却永远失却了作为人类的梦与心。那块神秘的属地被称为地狱门，从中走出的异能者被称为契约者。
从此，苍穹被异现象重新构建，皓月消失，星辰移位，夜空成为了契约者们的谱系，标识着他们的行动与消亡。与星辰签订契约的那群夜行者，则需以某种精神束缚行为为代价，做出违背人类本性的事情，用以交换超能力，否则便会丧失全部心智，沦为无心灵媒体DOLL。一切异象的出现都是难以用科学解答的谜题，契约者的存在在民众面前被当成秘密掩盖。曾有学者小分队进入过地狱门内调查，最终却只有一人生还归来。国际各大机构对其重视不已，日本的警视厅、英国的MI6、美国的CIA都在紧锣密鼓地进行着地狱门的调查研究，甚至还有个超越国界的庞大组织潘多拉，动用着凌驾于任何超能的力量，妄图消除所有契约者。了解到组织目的的契约者们缔结了EPR（月见草），默默与之对抗。就好像世界上绝不会有并存的星空，人类与契约者间势必会有一场存亡之战。
故事从接受“组织”的命令开始执行任务的契约者黑为轴心展开。而东京表面上看去仍然一尘不变，但是在东京的里侧由地狱之门创造的迷一般的领域，各国的谍报机关正利用着“契约者”展开炽烈的谍报战。主人公黑以中国留学生李舜生的身份游走于东京的各个街道，身位组织暗部的一员，在执行严苛的任务时赢得了“黑之死神”之名。而与黑同一小组的还有憎恨着契约者的人类黄，能够附身于动物但失去肉体的猫，能放出水中移动的观测灵来侦察的DOLL-银。
在执行组织任务中黑再次遇到曾经的恋人琥珀，而琥珀的言行愈加充满神秘，似乎背叛之下有着许多难言之隐。为了找到妹妹，黑追踪着琥珀，渐渐的看到混战背后更大的秘密。
第一个故事是李被组织派去获取一份关于门的资料,以学生身份救了持此资料的某女,一直保护她不被另一组织抓走,同时也骗取她手中掌握的资料.中间有许多的情感细节,这里不说了.最后结果是这个某女其实是那个组织派出来钓李的人偶.但是最后李差点死了,是这个人偶为他挡了一个契约者的一次能力,救了李一命.
第二个故事是说一个10年前参与一次考察门的活动,结果其余的人都死了,只有这个博士活了下来.并从门的领域内带出了一种可以抑制契约者的花.而这个博士的女儿就是一个契约者.博士不希望自己的女儿变成一个没有幸福的契约者.就用那种花抑制了女儿的能力.但是以致不是特别的稳定.开始的时候还可以.到了讲述故事的时候,女儿的能力开始在无知觉的时候觉醒. 而各大组织为了夺去博士对花的研究成果.都纷纷派出人来夺取.李被安排在博士工作的工厂内打工,以工人的身份介入到了博士与女儿之间,并间接的挽救了他们之间的父女亲情,但是最后的时候他们的芥蒂没有了,博士却也死了.李所在的组织获得了最后的胜利带走了博士的女儿.
第三个故事讲的应该算是契约者的生活. 同样的,有一个当年十分强大的女契约者,但是现在能力却消失了,被英国方面的契约者在日本捕获.李的组织在英国的契约者押送的时候把她夺了过来. 本来应该交给组织.但是因为黑的一些个人原因把她私自带走了. 原来他们从前是认识的,在某次活动中他们共四人有黑,抓到的这个契约者,还有黑的妹妹,还有一个没交代的人,活动后黑与妹妹失去了联系,到处都找不到其他人,这次抓到了这个契约者,黑想找出妹妹的所在,但是这个契约却在那次活动后失去了记忆.为了找到妹妹,并且也因为这个契约者因为失去能力的关系有了正常人的思想感情.所以黑决定恢复她的能力.这个契约者告诉黑,如果她恢复能力后变的和以前一样的话就把她杀了(去门那里可以恢复能力).但是在那里这个契约者被英国方面的契约者杀了.结果到最后黑也没得到妹妹的踪迹. (手好累,剩下两个我就把大概的事说一下好了,具体自己看更有意思)
第四个故事,讲一名前面几个故事都有偶尔出现的一个女警官与她的一个从前的同学,那同学是香港黑社会龙头社团老大的女儿,描述了这个社团内部变故时女警官与她同学之间的情感戏份.
第五个故事说的是黑搭档中的观测灵被别人捕捉后那个契约者暂时失去了记忆 从而引出的她成为契约之前的生活.最后结束的时候与黑确定了伙伴的关系. (对了,还有一个我忘说了,是有关于气味的,中间有一些无厘头的戏份.其实主要是想表达契约者的悲哀,一名契约者可以换别人的身体,但是在以前的某个时间却丢失了自己的身体,为了回忆自己,他没次使用完能力都会闻自己真正的身体曾经穿过的袜子.闻袜子回忆,够悲哀吧.......
