首先故事的主线是一项政治阴谋，俄国现任总统（简称A）的政策令他的敌对派系不爽，于是他的一个政敌（简称B）就自导自演了一出剧，首先B用皮肤移植手术把自己整容成A，随后匿名雇佣了“组织”的杀手（47号）在A的演讲会上枪杀了他，所以一开始枪杀的那个是真的。
随后，整容后的B再次出现在人们面前（取代A成为总统），并让“组织”骗47说A没死，并且47刺杀过程中被目击者（女主角）看到了，要47再去杀女主（实际上是因为，女主是A的女友，B为了安全起见要铲除她），同时为了确保万无一失，B还雇佣了“组织”的其他杀手一并铲除女主和47。
但47在杀女主的过程中对任务产生了怀疑，在与女主接触时进一步触动了内心的道德情感，所以违背了任务没有杀死女主，而是想追查出真相。
追杀47的有：东欧的警察，俄国的警察（B的手下）和“组织”的杀手。
47和中情局的人做了个交易：47帮其杀死毒贩（A的弟弟），中情局则帮47脱身。
47本身是一个犯罪组织制造的克隆人，受雇于一个叫“组织”的杀手机构。该组织内有大量克隆人。
扩展资料:
《杀手：代号47》是由美国20世纪福斯电影公司发行的动作犯罪片，由泽维尔·杨思执导，蒂莫西·奥利芬特、多格雷·斯科特、欧嘉·柯瑞兰寇领衔主演。影片于2007年11月21日在美国上映。
该片根据游戏改编，讲述了雇佣杀手代号47，因为一场政治阴谋而成了替罪羊。他逃去东欧，却依然甩不掉国际刑警和俄罗斯军方这两方面的共同追捕的故事。
剧情简介
代号47是一个神秘且复杂的男人，内心深处一直互相纠缠，在矛盾和否定而痛苦地挣扎着，虽然他是这个世界上最大的犯罪组织利用基因工程克隆出来的，却是由博爱的教会抚养长大的，所以对于他来说，也许存在的本身就是一种违背了生态平衡的错误。
即使他很有才华、魅力超凡且非常迷人，但是他真正能够拥有的东西却是少之又少，连名字都成了一种奢望，而惟一能够确认他的身份的，似乎就只有后脑勺代表数字的两个条形码文身了。
杀人是代号47一直从事的的工作，他从未觉得夺走别人的生命有什么不妥，工作的时候也从不流露个人情感，坚定到令人发抖的决断力，让他以一种俯视的高傲态度看待着身边走马观花般变化的一切，他的生活就好像是一个不断重复的方程式，日复一日。
然而，就算是智者也没办法掌握无常的命运，计划好的生命也有可能出现偶然的概率，代号47发现自己深埋已久的道德心突然开始活跃起来，一种从没体会过的陌生的情感波澜也浮上心头，而这一切变化，都发生在他遇见一个神秘的俄国女人后。
参考资料:杀手:代号47-百度百科
