百年药厂承工制药的老板李总（刘桦 饰），决定炒楼盘卖地，不想再卖药了。他重金聘请的香港高管阮大志（林俊贤 饰）牵线找来日本的买家宫下先生。不想，宫下看中的只是能够治愈失眠的玉露散神片的独家配方。 就在双方谈判陷入僵局之时，声称手握秘方的“神秘人S”的出现更让谈判迷雾 重重。承工制药厂销售总监林以泰（苏有朋 饰）是一名重度失眠患者，整日似梦非醒唯唯诺诺工作的他，却阴差阳错
影片《最佳嫌疑人》以多线索的叙事方式展开，潜心打磨剧本，注重气氛营造，在轻松搞笑的同时，又悬疑重重。商战元素作为剧情的重大线索将被全新演绎。人物之间智商拉锯的巧妙剧情、心理游戏的细腻刻画，这些既考验观众的智商情商又与现实生活拉近。
其次，该片汇集了失眠者、偷窥者、敲诈者、抓贼人、扮鬼人、抑郁症患者等一批小人物，他们在片中为了金钱、爱欲等欲望展开和他人、以及和自己的命运较量，使得整部电影犹如一场智商拉锯战。现实中可能没有像《最佳嫌疑人》中如此天衣无缝的骗局，但商业场上人心的尔虞我诈，人性的贪婪本能，电影中的刻画都精彩真实不逊于现实。
而后，林以泰忘记了自己就是神秘人S，转而穷追不舍的追查神秘人S是哪个人，其实从始至终都是他自己，当然，他的合伙人就是阮大志的情人，也就是陈乔恩演的那个角色，而拿走那一箱钱的也是林以泰。
所以，从根本上来说最佳嫌疑人就是一个重症失眠症患者自己追查自己创建出来的一个虚拟人物身份的一个电影，其他的全是故弄玄虚。