玩家需点开任务，在限定的时间以及限定的己方HP等多个制约条件下，通过消灭小怪，积攒魂魄，发动必杀技攻击场景中央的大BOSS，最终消灭BOSS。
游戏的战斗场景下，左上方是人物的PH槽和集气数，随着玩家的等级上升，集气最大数会上升，集满气后(按〇键进行触发，再快速连打，每连打一次，消耗一滴气力，全气力连打会触发动画)再攻击BOSS，造成的伤害会更多。
右上角是玩家的人物切换显示区，每个人物都有可以使用必杀技，人物头像左侧有两个金黄色的小圈，如果亮着就代表可以按L键触发大招。普通攻击(口键)三下之后，还会有个1秒左右的空挡，此刻玩家什么事情都做不了，容易被怪击中。若是BOSS对你发动攻击(参见主角的小跟班，一般BOSS在大招之前跟班会发出感叹号)，可以按X键进行躲避，另外，按X键也可以跳跃到空中攻击怪物。
被BOSS或者小怪击中，玩家除了扣除HP之外，也会冒出黑色的精气，被BOSS吸收。通过R键切换武器后，还可以按△键发动远程攻击(使用次数有限制)。此外，还有一个极其好用的组合键攻击，就是↓键 口键，特别是玩家拿着片手剑的时候效果显著，长按口键也可以发动强力的攻击，
同大多数游戏类似，本作也附带属性制衡系统，三属性相互克制，以及“无”属性，在战斗开始的任务详细页，可以得知BOSS的属性(小怪和BOSS属性基本一致)以及等级，这时候就可以选择同调参战的魔法少女(与其说是选择魔法少女还不如说是选择武器，实际战斗中玩家只能看见武器改变)，每个魔法少女都有自己专有的属性，选择优势属性的魔法少女对战斗方便不少。无属性不被任何属性克制，不过其攻击力略显得低，甚至不如同属性的武器攻击伤害大。
任务分四种类型，第一种任务是战斗，第二种任务是招募任务，可以通过完成该任务，收集各个地区的魔法少女，而触发出该任务的条件就是不停地刷副本任务，每次战斗成功之后，都会填爱心槽，填满之后就可以触发出一个招募任务，一般带有剧情。第三种任务是紧急任务，一般出现在玩家任务失败之后，目的的为了救出被困的某位魔法少女。第四种任务是副本任务，通过不断的战斗，获得经验，玩家的净化等级才能上升，随着净化等级上升，一些新副本才会不断冒出，部分副本虽然出现，如果玩家的净化等级不够还是无法进入，根据屏幕最下方提示，在无法进入的任务条目前按△键可以查看最低进入的条件。之所以要不断开阔副本地区，其中一个很重要的原因是，每个地方的土特产不一样，消灭怪物有概率获得土特产。土特产有三个作用，“属性加成，把妹利器，入手奖杯”。
主角的净化等级上升之后，还可以解开同调战斗最大人数和战斗携带物品的限制，携带更多的人物，对战斗的局势有相当大的影响，至于战斗携带的物品，可以根据任务中BOSS的属性，携带对应属性抗性加成的物品。本作中HP是人物所能承受的伤害最大值，MP是指远程的属性攻击次数。
每场战斗，都会消耗出战人物的体力，消耗完了就得休息，无法出战。 每次战斗结束之后，都可以赠送每个魔法少女一份礼物，这里就需要玩家根据每位魔法少女的喜好，以及出身地，赠送其喜好的物品，帮助快速增加等级。魔法少女的等级上去了，攻击力以及各方面属性也会上升，对之后的战斗也有很大的帮助。挑适合妹子的物品，即使是C等级的物品，也会有较大的收效。
奖杯，游戏刚开始完成教程就可入手第一个奖杯，剩下的两个奖杯就只需不断得完成副本任务，使主角的净化等级上升，填满爱心槽，触发魔法少女任务，解放相应的地区即可。
