新西兰老科学家发明的三菱镜通过光波可将人内的潜意识发挥到极点，成为一种超能力。当KING KONG（许冠杰）正接受这项试验之际，反派组织遣杀手用直升机袭击实验室，夺实验报告及枪杀了老科学家。幸得科学家三女Sally（叶倩文）出现，KING KONG便取了菱镜并逃出险境。返回香港后，KING KONG便往找拍档光头神探（麦嘉）帮助，希望将整个事情真相查个明白。
《最佳拍档》系列电影是新艺城电影公司的当家力作，自上一年其续集作品《最佳拍档之女皇密令》拿下票房冠军，创造新的卖座纪录之后，公司当即快马加鞭，赶制了新一部续集，不仅保留了原来常用的经典演员阵容，而且启用了签在手中几年却时常被闲置起来的大导演林岭东。
