乙坂有宇拥有着只在极少一部分的青春期少年少女身上诱发产生的罕见特殊能力，依靠这份能力度过着一帆风顺的学园生活的他，经由与神秘少女友利奈绪的邂逅，揭开了特殊能力者们身上的宿命。
标题《Charlotte》是来自于作品里面出现的“Charlotte彗星”。正是因为这颗彗星的粒子对于人体产生了影响，因此才导致青春期会出现超能力的现象。也就是说，Charlotte彗星是能力者诞生的原因。
故事的最后乙坂有宇使用自己的最强超能力“掠夺”，掠夺了世界上所有超能力者的能力，拯救了所有的超能力者。
相关剧情——记得曾经的约定：不明组织绑架了奈绪，在之后乙坂有宇的营救活动中，乙坂有宇右眼受伤，无法发动时间穿越能力，崩溃中发动了来自妹妹的崩坏能力引起坍塌，奈绪被哥哥的好朋友熊耳所救，熊耳为保护奈绪而牺牲。
奈绪在医院里和乙坂有宇谈论后，告诉乙坂有宇，如果他能够掠夺所有能力者的能力，以此来拯救世界上所有的超能力者，等到两人再次重逢时就跟他成为恋人。
“等你拯救所有的超能力者之后，我们重逢的那一天，到那时候，我们就在一起吧！那我们约好了，你一定要回来。”
“我绝对会回来。”
奈绪在医院里和乙坂有宇再次相遇，然而有宇却失去了记忆。奈绪告诉有宇，自己和失忆的他是恋人关系。
※“我约定过的，把世界上所有能力全部夺取，然后回到她的身边。她？是谁来着？”
“我啊，是你的恋人。”
感人台词：乙坂有宇：
“我约定过的，把世界上所有能力全部夺取，然后回到她的身边。她？是谁来着？”
友利奈绪：
“辛苦了，你守约了呢。”
乙坂有宇：
“话说回来，你是？”
友利奈绪：
“结果是这样啊……我啊，是你的恋人。”
乙坂有宇：
“对不起，我什么都想不起来。”
友利奈绪：
“那个单词本，是我做的。”
乙坂有宇：
“诶？这个……是你？”
友利奈绪：
“是。”
乙坂有宇：
“这个对于我来说就像是护身符。”
友利奈绪：
“十分……感谢。”
乙坂有宇：
“不过，别哭哦。”
友利奈绪：
“我做不到……乙坂有宇，欢迎回来。”
曲:伍乐城词:林夕编:伍乐城
分享过你这种漂亮
离得开了你令我坚强
让我的乾燥皮肤擦响
愿我的内心未擦伤
假使当初可以为了你忘了爱所有人
分开手去追寻足可拥抱千万人
即使天空海阔没有爱还有你这个人
烧光一个森林将灰烬里的热能
当做一点陪衬
请不要说改天再会
何不乾脆说下次失陪
让那张温暖床单晒乾
路过的地方别再躺
假使当初可以为了你忘了爱所有人
分开手去追寻足可拥抱千万人
即使天空海阔没有爱还有你这个人
烧光一个森林将灰烬里的热能
当做一点陪衬
假使当初可以为了你忘了爱所有人
分开手去追寻足可拥抱千万人
即使天空海阔没有爱还有你这个人
即使不再光临一想起你
怎么可以对任何人热吻
