从移住至宇宙殖民地开始经过了几百年后的宇宙时代。人们皆以为争夺地球圈霸权的战争结束，和平的时代已经到来，但和平却无常地脆弱瓦解。被宇宙殖民地「诺拉」的联邦军基地阿林斯顿收留，菲利特平安成长到14岁。与基地的工程师一起研究了7年的菲利特终于成功开发出「敢达」。开发成功的敢达搭载了能让机体自行进化的划时代机能「AGE系统」。但是恐惧的时刻即将来临，UE的魔掌终于逼近了和平的宇宙...
宇宙殖民地移民经过数百年的宇宙时代，争夺地球圈霸权的战争结束了，本以为和平的时代已经来临，然而却是快要面临着崩毁。
A.G.（Advanced Generation）101年
突如其来的不明敌人（UE=Unknown Enemy）攻击宇宙殖民地“天使”并使其崩毁，这死伤惨重的悲剧日后被称为“天使的落日”，之后UE对居住在地球圈的人们带来长期的危害。
A.G.108年
与UE的战斗持续着，原本和平的宇宙殖民地“奥凡”也遭到袭击，居住在此的7岁少年弗利特·明日野在战火中失去了母亲玛丽娜·明日野。不过，母亲在临终时，将家中代代相传的被称为救世主的古代MS“高达”的设计图，弗利特继承了家族的意志，决心造出高达。
A.G.115年
14岁的弗利特被宇宙殖民地“诺拉”的联邦军基地阿林斯顿接收。七年间，和基地的工程师们持续着研究，终于完成了高达。这部搭载了“AGE系统”的高达，能够令机体自我进化。
然而，可怕的时刻终于来临……
UE的魔爪终于逼近和平的殖民地“诺拉”。
如今，弗利特开动自己制造的高达，挺身而战。
到底弗利特能战胜14年间都不能战胜的可怕敌人UE吗？
历经明日野家族3代人的“百年战争”由此展开……
