天空之城拉普达族民的灭亡是由于内乱。
拉普达人察觉到了表面的繁盛下所潜伏着的危机，因此拉普达的首领为了不让这个天空都市落在邪徒手中，忍痛念动毁灭之咒动灭之咒。
这一举动让天空之城的科技、财富和武器等所有拉普达文明的痕迹统统化为灰烬，只剩下一棵大树载着拉普达城的残骸永远消失于天际。
《天空之城》的创作原由：
纵观宫崎骏的所有动画电影作品，不难发现“飞翔”是其永恒的主题。在本片中，他更是将舞台搬到了一座“空中楼阁”之上——天空之城拉普达。这是一座以反引力装置的飞行石为悬浮动力的空中城市。
满怀强烈的社会意识和人文关怀的宫崎骏试图通过对文明失落的根本原因的追问，影射出人类文明的现存弊端，并对文明如何才能生存、发展的哲学命题进行探讨。而这一切，都是通过拉普达这座虚构的天空之城的兴衰来表现出来的。
在影片中，拉普达城出现时已是一座空无一人的废城。人们只能通过巨大的飞行石、不计其数的机器人、堆积如山的财宝来遥想其当年的繁盛。宫崎骏显然无意于着重向观众介绍拉普达文明产生与发展的过程。
他仅仅是以这种曾经极度繁盛的文明的最终毁灭来强烈地震撼和冲击每位观众的心灵，从而对现代社会中的芸芸众生提出质问，并最终来思考人类文明应向何处发展的现实问题。