在星际之门：宇宙星际之门的第二季中，Lucian联盟成为了故事的重要组成部分，他们将长期驻留在命运号上。联盟战士Varro与Young上校之间的对抗以及Sumeon与Rush博士的冲突为剧情增添了紧张气氛。Ginn女科学家的频繁出现也为故事增添了新的线索。Lucian联盟的到来使得命运号的生活需求大幅增加，食物和水源的寻找成为核心情节线之一，而船员们在合作与对立中寻找生存之道。
爱情元素在第二季中丰富起来，Matt和Chloe的关系更为复杂，Eli和Ginn之间萌生情愫，Amanda Perry博士与Rush博士重燃旧情，而T.J.的情感生活也有了新的发展。Rush博士在第二季第二集中解锁了命运号的控制密码，与舰桥（控制室）的发现成为关键转折点。但他并未立即分享这一信息，直到第七集Young上校意外揭示了这个秘密。
Chloe在第二季中经历深刻的变化，包括精神与身体上的转变，她的外貌可能隐藏了被外星人改造的痕迹。船员间的内部矛盾在与Lucian联盟合作时有所减少，大家团结一致，以生存和共同目标为主。第二季的目标转向了探索命运号的使命，寻找它的最终目的地以及古人发射它的真正目的。在第三集中，命运号发现了一艘古人的星门播种船，这将是他们新的探索任务。
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星际之门：宇宙 简称SGU。是米高梅公司以1994年的卖座电影“STARGATE”为蓝本延伸制作的电视影集，是星际之门：SG-1(STARGATE SG-1)和星际之门：亚特兰蒂斯(Stargate Atlantis)的分支剧。
星际之门:亚特兰蒂斯第二季是一部以科幻冒险为主题的美国电视剧，由Joe Flanigan、Rachel Luttrell、David Hewlett、Jason Momoa和Torri Higginson等实力派演员主演。剧情围绕着在南极洲发现的神秘星际之门展开，这个设备连接着天马座上远古人类建造的亚特兰蒂斯文明。
探险队由科学家、医生和军人组成，其中包括富有领导力的女队长韦尔博士，精明的军方领导人谢帕德少校，以及技术主管罗德尼·泽兰卡中尉，他的滔滔不绝经常引起同伴的不满。团队还包括医生卡森以及后来加入的女战士泰勒，她既性感又勇敢。在亚特兰蒂斯，他们面临着一系列神秘事件和来自各星球人类的挑战，特别是来自幽灵族的威胁，这些幽灵不仅凶残好斗，还拥有先进的武器和科技，数量庞大。
第一季在幽灵族对亚特兰蒂斯的猛烈攻击中留下了悬念。在第二季中，这些悬念得到了延续，同时也引入了新的情节线索。韦尔博士和谢帕德少校的情感纠葛成为关注焦点，福特中尉因意外获得幽灵族酶而力量增强，他的命运如何？探险队能否找到新的零点模块（ZPM）以维持亚特兰蒂斯的运作？幽灵族的围攻又如何解围？这些悬念在第二季中一一揭晓，等待观众去揭示答案。
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星际之门：亚特兰蒂斯(Stargate Atlantis)，简称SGA，米高梅公司以1994年的卖座电影“STARGATE”为蓝本延伸制作的电视影集，是星际之门：SG-1(STARGATE SG-1)的分支剧。星际之门：亚特兰蒂斯2004年起在美国与Stargate SG-1第八季同时播出，目前已播完第五季。